O intestino é um ecossistema frágil no qual interagem a microbiota, o epitélio intestinal e o sistema imunitário. A microbiota, ou flora intestinal, desempenha um papel importante em muitas funções fisiológicas do trato gastrointestinal. É composta por microrganismos vivos que constituem uma barreira real contra agressões externas. Quando essa barreira é enfraquecida, afeta a digestão e o funcionamento do intestino.